通过药物作用的靶点来设计开发创新药物是目前创新药制剂开发的一条重要线索，每年都会有作用于新靶点的药物上市，为治疗疾病提供了全新的作用机制，也为一些无法治疗的药物提供了新的希望，因此药物靶点筛选和确定对于创新药物研发具有巨大的潜力。
SEMA4D（轴突导向蛋白4D），又称为CD100，在许多人体肿瘤组织中高表达，对血管发生及肿瘤侵袭和转移起到了重要的作用。如在裸鼠成瘤实验中，发现抑制裸鼠直肠癌移植瘤模型的SEMA4D的表达可以减弱癌细胞诱导内皮细胞迁移的能力，显著减缓移植瘤生长速度并降低瘤体内血管的密度。新生血管形成是恶性肿瘤侵袭转移的关键环节，SEMA4D作为重要的促血管生成因子，可以诱导内皮细胞的迁移和管腔形成，因此SEMA4D具有促进肿瘤细胞增殖的作用。
蛋白质与蛋白质之间的相互作用是细胞的各种重要生理活动，细胞对外界环境及内环境作用的反应等的纽带，通过这个纽带可以形成信号转导网络系统。研究两种蛋白之间是否具有相互作用，为深入认识和理解各种生命现象提供了必要的前提。
质谱是一种进行药物代谢产物分析的重要技术，它具有检测灵敏度高、分析的分子质量范围宽，提供分子结构信息量多等特点。而且质谱技术常与其他分析方法联用，如色谱仪、电泳等，这使质谱的应用范围进一步扩大。如有研究者采用超高压液相色谱-飞行时间质谱仪进行药物在大鼠体内的代谢产物分析，来探究药物发挥药效的物质。
细胞角蛋白18(Cytokeratin 18,CK18)作为人类细胞角蛋白家族中的一员，是构成肝细胞骨架的主要中间丝蛋白之一，与肝癌、病毒性肝炎和酒精性肝病等明显相关。为了获得足够多的蛋白来研究其生物学功能，可以构建蛋白表达载体进行蛋白表达，一些公司提供蛋白表达服务。关于CK18对癌细胞的作用研究的文献也有很多，如有研究者克隆人细胞角蛋白18基因(CK18)编码区并构建重组真核表达载体pEBFP-CK18,研究其对Hep G2肝癌细胞增殖和迁移的影响，发现其对肝癌细胞Hep G2的迁移具有促进作用。此外还有研究发现CK18 与肿瘤侵袭和转移密切相关，可以作为恶行肿瘤辅助诊断的主要依据。
通过毒代动力学试验可以了解全身暴露情况下毒物反应的物质基础特征，能获知受试物在毒性试验中不同剂量水平下的全身暴露程度和持续时间，评价受试物蓄积引起的靶部位毒性，不仅有助于为进一步进行其它毒性试验提供依据，还有助于预测药物在人体暴露时的潜在风险，为今后临床用药以及药物过量的诊断、治疗提供依据。
在进行生物技术药物研发时，使用免疫原性检测技术快速、可靠地预测生物技术药物在体内的免疫原性对于开发新的蛋白治疗药物如疫苗具有非常重要的意义。进行抗病毒疫苗研发时，判断某种疫苗是否具有免疫效果，体现在免疫机体后能否产生足够的中和抗体。对于一些致病性和传染性很强的病毒，操作活菌面临着危险性高、周期长、实验条件要求比较苛刻和对实验室要求严格和等情况。此时，假病毒技术是一种非常有效的研究手段。
趋化因子是一类在炎症反应中可诱导白细胞募集和激活的多肽蛋白，可介导多种免疫细胞进入肿瘤微环境，帮助T细胞进入肿瘤并影响肿瘤免疫和治疗效果。趋化因子 CCL5是趋化因子家族成员之一,主要定向趋化和激活 T 淋巴细胞和 NK 细胞，在肿瘤和炎性疾病中发挥重要作用，进行CCL5原核表达系统表达研究可以为研究该基因的生物学活性提供研究基础。
Ames试验是由由美国加利福利亚大学伯克利分校生化系B.N.Ames教授实验室在1975年建立的鼠伤寒沙门氏菌回复突变试验，从建立到后来的不断完善，现在Ames试验被广泛应用于化合物的致突变性和潜在致癌性的初筛检验。为了对Ames试验有更多的了解，特收集整理了网上的资料，对Ames试验的类型进行了盘点。
在抗肿瘤药物研发中，随着对肿瘤发生发展机制研究的不断深入，以肿瘤发生发展过程中的相关酶、受体等为作用靶点，可以进行抗癌化合物活性筛选研究。通过化合物活性筛选从大量化合物中挑选出一些苗头化合物，可加快新药研发速度。有学者研究发现，肿瘤细胞中的 DNA 拓扑异构酶表现出不受其他因素影响的高水平表达， 因此， 抑制 DNA 拓扑异构酶的活性能够阻止肿瘤细胞的快速增殖。目前，抑制 DNA 拓扑异构酶是筛选具有抗肿瘤活性的化合物的一种方法，而且基于此方法已经筛选出一些新的具有潜在抗癌活性的化合物。
