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长非编码RNA与癌症的关系

大多数人类基因组由非经典基因组成,例如长非编码RNA(lncRNA)。IncRNA基因是哺乳动物细胞转录的主要来源。尽管已经建立了某些lncRNA的癌症连接,例如:MALAT1作为结直肠癌患者生存的预后标志物,目前尚不清楚大多数lncRNA在恶性疾病中的作用。长非编码RNA与癌症的关系

 

一些编码MHC结合肽的PRMT5-E2F1响应性lncRNA,如MALAT1和DANCR,已知在人类癌症中表现出失控表达。因此,科学家们评估了一些表征不太好的肽编码lncRNA的表达模式,确认了MALAT1和DANCR在一系列癌症和正常组织中的表达。其他lncRNA的表达模式是可变的。例如:VPS9D1-AS1表现出异质表达,在某些癌症中表达高,在正常组织中表达通常较低。这与CTC-459F4形成鲜明对比。值得注意的是,编码MHC I类结合肽的人lncRNA表现出与小鼠lncRNA相似的表达谱,即在正常胸腺中的低表达。

在对一系列CRC肿瘤细胞系的详细分析中,一些lncRNA基因表现出高表达,而另一些则表现出低表达。有趣的是,分析lncRNA在人结直肠癌、胃癌和食管癌中的表达时,微卫星稳定(MSS)和微卫星不稳定(MSI)亚组的表达存在明显差异:在结直肠癌中,大多数lncRNA表达发生在MSS亚组而不是MSI亚组中,MSI亚组在胃癌和食管癌中不太明显。因此,通常编码MHC I类相关肽的lncRNA的表达谱受癌症类型和疾病阶段的影响。

 

 

参考文献:

[1] Wojciech Barczak, Simon M. Carr, et al. Long non-coding RNA-derived peptides are immunogenic and drive a potent anti-tumour response. Nat Commun. 2023; 14: 1078. Published online 2023 Feb 25. doi: 10.1038/s41467-023-36826-0.

[2] Shanshan Zhao, Xue Zhang, et al. Long noncoding RNAs: fine-tuners hidden in the cancer signaling network. Cell Death Discov. 2021 Oct 11;7(1):283. doi: 10.1038/s41420-021-00678-8.